研究人员发现Tsimane和Mosen基因组中与免疫的进化选择

一个由全球专家组成的团队在人类身上发现了自然选择的新信号。

在加州大学圣巴巴拉分校Tsimane健康与生活史项目联合主任Michael Gurven的带领下，该团队研究了生活在玻利维亚亚马逊雨林中的两个种群 - Tsimane和Moseten。先前的研究表明，这些热带人群暴露于许多寄生虫和各种病原体;同时，天门人很少患心血管疾病和痴呆。这项新的研究表明，Tsimane基因组已经经历了与免疫和新陈代谢相关的性状的选择。

这项工作增加了世界各地人类进化和专业化的背景，超越了一些众所周知的案例。例如，欧洲人、一些非洲人和中东人的后代可以将乳糖消化到成年期，这在这些人群中保持了他们在青春期后喝牛奶的能力。该研究发表在《美国国家科学院院刊》上。

根据主要作者和范德比尔特大学教授Amanda Lea的说法，“尽管对了解人群之间适应性差异的DNA变异非常感兴趣，但仍然难以识别和表征这些变异。然而，这项工作很重要，因为我们可以发现基因组中不同的部分，从进化和生物医学的角度来看都很重要。

这项研究的一个特别独特的部分是它的起源：Tsimane健康和生活史项目与Tsimane和Mosen社区之间的合作。20年来，该项目包括人类学家、医生、土著领袖、社区成员和地方机构之间的联合工作，以建立他们的健康状况并改善健康状况。

这种值得信赖的伙伴关系对于围绕研究土著人口DNA的道德环境至关重要。事实上，该团队已经开发了一种共享数据的新系统，该系统平衡了开放科学的目标与公平、公正和土著数据主权的需求。这是西方科学努力解决人类基因组工作缺乏多样性等问题的前进方向，以及许多土著人口对参与遗传和生物医学研究的历史沉默和不信任。

“大多数将DNA突变与健康联系起来的研究都在欧洲或北美人群中进行，”Gurven谈到与南美洲低地原住民合作的重要性。“像Tsimane这样的群体有着不同的历史，生活在不同的环境中。Tsimane特有的遗传变异在最常研究的人群中不存在，这是合乎逻辑的。探索独特的变异及其与健康后果的关系是我们正在做的事情，我们对此感到非常高兴。

使用各种技术，他们在基因组中发现了21个席卷Tsimane人群的区域，包括影响对微生物和大型生物的免疫防御的关键参与者，以及脂肪如何被我们的细胞代谢。他们发现免疫相关性状受到同时发生在多个遗传区域的选择的影响(称为多基因选择)。他们还表明，血液中表达的许多基因与免疫功能有关，调节基因会影响白细胞计数，血胆固醇和血糖水平。

研究人员的一个令人惊讶的结果是发现，似乎有一种有益的变体会影响Tsimane使用能量的方式。先前的研究表明，美国或欧洲人群中的有害等位基因，包括增加阿尔茨海默病风险的载脂蛋白-E4，在具有许多传染因子和能量有限的环境中具有减弱甚至积极的影响，例如Tsimane居住的地方。研究影响免疫力、感染风险和心脏代谢健康的遗传变异可以极大地促进我们对为什么有害等位基因今天仍然存在的理解。

该项目是与Tsimane一起进行的，Tsimane是玻利维亚超过35个土著群体之一。Tsimane人口包括17个村庄的约000，90人。Tsimane Health and Life History Project在1年至000年期间从2006多人身上收集了血液样本。

从血液样本中收集了DNA和单核苷酸多态性的信息，研究小组确定了基因组中经历正选择的区域。研究人员使用统计程序和在线数据库来确定与免疫相关的遗传区域的相关性。该小组还研究了基因型(基因)和表型(这些基因如何表达)之间的关系。

未来，该团队计划探索Tsimane基因可能与其他人群(如欧洲人)不同的其他方式。它还将利用其他生物医学技术(包括转录组学，代谢组学和微生物组)建立Tsimane人的丰富参考，以将遗传学与健康联系起来。

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